يحصل النيل الأبيض على مياهه بشكل أساسي من بحيرة فيكتوريا (ثاني أكبر بحيرة عذبة في العالم) الواقعة في منطقة البحيرات العظمى بشرق إفريقيا. يتدفق النهر عبر أوغندا (كنيل فيكتوريا) ثم بحيرتي كيوجا وألبرت، ويتلقى مياهاً إضافية من أمطار الهضبة الاستوائية، ورافدي بحر الجبل وبحر الغزال في جنوب السودان.
أهم المصادر والمنابع:
بحيرة فيكتوريا: المصدر الرئيسي، وتقع على حدود أوغندا، تنزانيا، وكينيا.
بحيرة ألبرت ونهر ألبرت: يغذيان النهر في مساره.
بحر الجبل: يمثل جزءاً هاماً من مسار النهر في جنوب السودان.
الأمطار الاستوائية: تغذي البحيرات والأنهار في منطقة المنابع في شرق ووسط إفريقيا.
يمتد النيل الأبيض بعد ذلك شمالاً عبر جنوب السودان والسودان، ليساهم بنحو 14% إلى 30% من إيراد النهر السنوي (حيث يتم فقدان جزء كبير من مياهه بسبب التبخر في مناطق المستنقعات قبل التقائه بالنيل الأزرق في الخرطوم).