يكمن الفرق الرئيسي بين التمساح (Crocodile) والقاطور (Alligator) في شكل الرأس؛ فالتمساح يمتلك خطماً طويلاً ورفيعاً على شكل حرف "V"، بينما رأس القاطور أعرض وأقصر على شكل حرف "U". كما تظهر أسنان التمساح السفلية عند غلق فمه، في حين تختفي أسنان القاطور تقريباً.
أبرز الاختلافات بينهما:
الأسنان: عند إغلاق فمهما، تظهر أسنان التمساح (خاصة السن الرابعة الكبيرة) بينما لا تظهر أسنان القاطور.
الموطن: يفضل التمساح المياه المالحة (الاستوائية)، بينما يفضل القاطور المياه العذبة (المستنقعات والأنهار).
اللون: لون القاطور أغمق (رمادي إلى أسود)، بينما التمساح أفتح (زيتوني أو بني).
العدوانية: التماسيح أكثر عدوانية وأكبر حجماً من القواطير.
الانتشار الجغرافي: القواطير تنتشر في أمريكا والصين، بينما التماسيح موجودة في أفريقيا، آسيا، أستراليا والأمريكتين.